细菌分子分型PFGE技术服务MLST、MLVA脉冲场凝胶电泳

一、脉冲场凝胶电泳分型(pulse field gel electrophoresis,PFGE)PFGE选用识别稀有酶切位点的限制性内切酶切割基因组DNA,获得的DNA片段在外加脉冲电场的低浓度琼脂糖凝胶中分离,产生数量有限的DNA条带。PFGE分型力好、分辨力高、可重复性好、已有成熟的标准化技术方案、已实现数据分析的网络化,对于大部分细菌是暴发溯

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  • 品牌:

    纳全生物

  • 产地:

    上海

  • 产品类别:技术服务
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    长期有效

  • 发布时间:

    2020-01-10 22:59

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纳全生物

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上海

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产品规格:

PFGE、MLST、MLVA

详情介绍




图1:聚类图 

一、脉冲场凝胶电泳分型(pulse field gel electrophoresis,PFGE)

PFGE选用识别稀有酶切位点的限制性内切酶切割基因组DNA,获得的DNA片段在外加脉冲电场的低浓度琼脂糖凝胶中分离,产生数量有限的DNA条带。PFGE分型力好、分辨力高、可重复性好、已有成熟的标准化技术方案、已实现数据分析的网络化,对于大部分细菌是暴发溯源中细菌分型的“金标准”。

 

二、多位点可变数目串联重复序列分型(Multilocus VNTR analysis, MLVA)

MLVA是以PCR为基础,根据被检菌株散在于基因组中不同位点的、VNTR的重复单元拷贝数的差异来进行分子分型的技术。VNTR: Variable Number Tandem Repeat ,数目可变的串联重复序列,又称卫星DNA (Satellite DNA)。

 

三、多位点序列分型(Multilocus sequence typing,MLST)

MLST是基于细菌核苷酸序列比对的一种分子分型方法,其原理是通过比较细菌个体7个或者更多管家基因的核苷酸序列的多态性,确定其基因多态性,同时通过划分序列群和构建小生成树来揭示细菌群体遗传结构。

 

四、其他细菌检测服务

耐药基因、毒力基因、特殊表型检测等。

 

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